碧云天生產(chǎn)的5'DNA Adenylation Kit,即5’DNA腺苷?;噭┖校且环N非常便捷和高效的通過酶學(xué)方法將單鏈DNA (ssDNA) 5’端腺苷?;揎椀脑噭┖?。
本試劑盒制備產(chǎn)生的5’端腺苷?;揎椀膯捂淒NA,常用于miRNA等3’端為羥基的RNA或3’端為羥基的單鏈DNA在克隆、高通量測序建庫或PCR檢測等時,在3’端添加的接頭。
本試劑盒進行腺苷?;揎椃磻?yīng)時,需要腺苷?;?Adenylase)、ATP和待腺苷?;揎椀?’端磷酸化的單鏈DNA。
本試劑盒腺苷?;揎椥矢撸ǔ?梢赃_到95%以上。對5’端磷酸化的單鏈DNA進行腺苷?;揎椃磻?yīng)時,無論該單鏈DNA的3’端是否進行了氨基化等封閉都可以得到高產(chǎn)量的腺苷?;a(chǎn)物。通常本試劑盒能將95%以上的5’端磷酸化的DNA (pDNA)轉(zhuǎn)化成腺苷酰化DNA (AppDNA),因此腺苷?;漠a(chǎn)物通常不需要進行電泳切膠回收,可以直接通常乙醇沉淀進行進一步濃縮后用于后續(xù)的連接反應(yīng)。
本產(chǎn)品以5’端磷酸化的單鏈DNA為底物,腺苷酰化酶將ATP分解成AMP和PPi,AMP轉(zhuǎn)移到單鏈DNA的5’磷酸基團上,形成腺苷?;瘑捂淒NA,從而制備出腺苷?;宇^(linker)。
本試劑盒催化5’端磷酸化單鏈DNA生成5’端腺苷?;揎梿捂淒NA的效果參見圖1。
圖1. 使用碧云天生產(chǎn)的5’ DNA Adenylation Kit制備5’端腺苷?;揎梿捂淒NA的效果圖。反應(yīng)體系為20μl,單鏈DNA的終濃度為5μM,反應(yīng)條件為65oC分別孵育15、30、45、60和90min,反應(yīng)完畢后85℃孵育5min終止反應(yīng)。電泳上樣前95℃孵育5min隨后置于冰浴以充分變性,尿素(7M)變性聚丙烯酰胺凝膠(15%)進行凝膠電泳分析。如圖所示,本試劑盒在15min內(nèi)就可以將大部分5’端磷酸化單鏈DNA (pDNA)催化生成腺苷?;膯捂淒NA (AppDNA),孵育60min可以確保將95%以上的底物轉(zhuǎn)化成腺苷?;揎椀膯捂淒NA。
本產(chǎn)品也可以用于5’端磷酸化的單鏈RNA的5’端腺苷?;揎?,可根據(jù)具體應(yīng)用選擇合適的實驗步驟,同時需要額外準備R0102 RNase Inhibitor和R0021 DEPC水等。
本產(chǎn)品包含的Adenylase來源為嗜熱古細菌,在大腸桿菌中進行表達而獲得。
優(yōu)點:單步反應(yīng)即可完成5’端磷酸化修飾的單鏈DNA或RNA的腺苷?;揎?,與傳統(tǒng)的化學(xué)方法相比較,更加簡便;對于底物轉(zhuǎn)化效率高達95%以上,無需切膠純化僅需酒精沉淀等即可用于后續(xù)反應(yīng);在65℃這樣一個較高的溫度反應(yīng),可以有效避免二級結(jié)構(gòu)對于5’端腺苷?;揎椃磻?yīng)的干擾;適用于pmol級別底物量的反應(yīng)體系,也可以很方便地放大至μmol級別底物量的反應(yīng)體系。
產(chǎn)品編號 | 產(chǎn)品名稱 | 包裝 |
R0716S-1 | Adenylase | 20μl |
R0716S-2 | 10X Adenylation Reaction Buffer | 25μl |
R0716S-3 | ATP (1mM) | 25μl |
— | 說明書 | 1份 |
產(chǎn)品編號 | 產(chǎn)品名稱 | 包裝 |
R0716M-1 | Adenylase | 100μl |
R0716M-2 | 10X Adenylation Reaction Buffer | 125μl |
R0716M-3 | ATP (1mM) | 125μl |
— | 說明書 | 1份 |
-20℃保存,至少一年有效。
注意事項:底物單鏈DNA或單鏈RNA的5’端磷酸化是必須的,3’端可以進行氨基化等封閉,也可以不封閉。
本試劑盒提供的腺苷?;磻?yīng)體系可以按比例放大反應(yīng)體系,對腺苷?;a(chǎn)物的得率無顯著影響。
本試劑盒提供的Adenylase的最佳反應(yīng)溫度為65℃,并且在25℃時會出現(xiàn)去腺苷?;F(xiàn)象,因此反應(yīng)完成后推薦在85℃孵育5min以失活A(yù)denylase。如果沒有失活A(yù)denylase,后續(xù)經(jīng)歷室溫溫度條件時,會導(dǎo)致腺苷?;嚷氏陆?。
本產(chǎn)品僅限于專業(yè)人員的科學(xué)研究用,不得用于臨床診斷或治療,不得用于食品或藥品,不得存放于普通住宅內(nèi)。
為了您的安全和健康,請穿實驗服并戴一次性手套操作。